Af bréfi sem Jón sendi Sveinbirni Egilssyni á afmælisdaginn sinn árið 1837 má ráða að hann hafi snemma fengið þá hugmynd að safna saman íslenskum fornbréfum og skjölum. Á þessum tíma vann Jón fyrir Danska vísindafélagið við að taka saman slíkt safn varðandi danska sögu og ekki er ósennilegt að hugmyndin sé þaðan sprottin. Vitað er með vissu að Jón var byrjaður að viða að sér efni fyrir Íslenskt fornbréfasafn árið 1845. Hann skrifaði upp skjöl og í sumum tilfellum vann hann umfangsmikla rannsókn, t.d. varðandi Gamla sáttmála. Jón leitaði víða fanga við söfnun fornbréfanna, svo sem í safni Árna Magnússonar auk skjalasafna í Kaupmannahöfn og einnig fékk hann aðra til að afrita skjöl, bæði á Íslandi, Englandi og víðar. Jóni entist aðeins aldur til að sjá fyrsta bindi fornbréfasafnsins en það var gefið út í fjórum heftum á árunum 1857-1876. Að Jóni látnum tók Jón Þorkelsson við verkinu þar sem frá var horfið og nýtti hann að einhverju leyti safn Jóns til verksins.
Síða úr handriti Jóns að Íslensku fornbréfasafni. Handrit Jóns að fornbréfasafninu eru alls 12 talsins og eru það uppskriftir Jóns af skjölum frá elstu tímum og fram undir 1590, uppskriftir annarra manna, sendibréf til Jóns varðandi einstök skjöl og jafnvel frumrit skjala. Hér er um að ræða uppskrift Jóns sjálfs úr safni Árna Magnússonar af skjali um eiða (JS 364 4to).
Skoða á Handrit.isEin þeirra uppskrifta sem Páll Pálsson stúdent skrifaði fyrir Jón í tengslum við útgáfu Íslensks fornbréfasafns. Páll var amtskrifari Bjarna amtmanns Þorsteinssonar að Arnarstapa. Páll vann síðar á Landsbókasafn bæði að uppskriftum handrita, viðgerðum og bókbandi (JS 363 4to).
Skoða á Handrit.is
„Íslenzkt fornbréfasafn, sem hefir inni að halda bréf og gjörninga, dóma og máldaga og aðrar skrár, er snerta Ísland eða íslenzka menn.“Skoða á Bækur.is